종자는 범어 bija의 번역이다. 씨앗으로부터 싹이 나오기 때문에 불교에서는 `믿음의씨앗` `원인의 씨앗`등 종종 비유의 대상으로 거론된다. 아뢰야식 가운데 선척적으로 존재하는 본유종자가 있으 며 후천적으로 경험하고 축적한 신훈종자가 있다. 일반적으로 종자에는 유루의 여러 현상을 일으 키는 유루종자, 보리의 원인이 되는 무루종자가 있다.